阮志勇

阮志勇，男，博士，研究员，博士生导师。主要从事农业微生物资源的发掘筛选、系统分类、功能评价及综合应用研究。入选国务院第三次全国土壤普查土壤生物专题调查技术指导组专家成员、研究所“优秀青年人才培育计划”（一级）、西藏农牧大学第四批柔性引进人才等，兼任中国微生物学会常务理事、微生物资源专业委员会主任委员等。近年来，主持国家自然科学基金（国际<地区>合作与交流项目、面上项目）、国家重点研发计划（课题、政府间国际科技创新合作任务）等各类项目20余项，在国内外期刊发表学术论文70余篇，获授权国家发明专利12项，获省部级奖3项。

教育背景

1994–1998华中农业大学微生物学专业理学学士

2002–2006中国农业科学院研究生院微生物学专业理学硕士

2007–2014华中农业大学微生物学专业理学博士

工作经历

1998-2003中国农业科学院农业资源与农业区划研究所研究实习员

2004-2016中国农业科学院农业资源与农业区划研究所助理研究员2017-2022中国农业科学院农业资源与农业区划研究所副研究员

2017-2018 加州大学戴维斯分校国家公派访问学者

2022-2024国务院第三次全国土壤普查领导小组办公室综合组干部

2023至今，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所，研究员

社会兼职

中国微生物学会第十二届理事会常务理事

中国微生物学会微生物资源专业委员会主任委员

中国绿色食品协会益生菌专业委员会副主任委员兼秘书长

国家微生物种业产业技术创新战略联盟常务理事

《微生物学通报》杂志编辑委员会委员

《中国沼气》杂志编辑委员会委员

《生物资源》杂志编辑委员会委员

科研项目

1. 国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目，澜湄区域亚洲热带水稻种植土壤微生物资源多样性及其功能研究, 3211101206，2022-2026，主持。

2. 国家自然科学基金面上项目，高效除草剂降解复合菌群中关键物种的培养组学研究与降解合成微生物区系构建，32070004，2021-2024，主持。

3. 国家自然科学基金面上项目，磺酰脲类除草剂微生物降解复合系的结构解析及稀有降解菌种的发掘，31670006，2017-2020，主持。

4. 国家重点研发计划课题，北方旱作区土壤健康监测评价与标准构建，2023YFD1900501，2023-2027，主持。

5. 国家重点研发计划政府间国际科技创新合作任务，农业有机废弃物微生物发酵与综合利用技术及应用研究，2023YFE0104900-4，2023-2026，主持。

奖励荣誉

新疆维吾尔自治区自然科学奖三等奖（2021年，第2位）

中华农业科技奖三等奖（2007年，第7位）；

中国农业科学院科学技术成果奖一等奖（2006年，第7位）

第四届“共享杯”大学生科技资源共享服务创新大赛优秀指导教师奖（2016年）

主要论文

1. Ma Q, López M.J, Zhang S, Jin L, Wei D, Yang J, Liu J, Ruan Z*. Carbon source-dependent activation of herbicide-mixture degradation in a synthetic microbial community enriched from black soil. Journal of Hazardous Materials. 2026, 506:141615

2. Xu J, Yang Y, Ma K, Wakisaka M, Ruan Z*. Co-producing functional xylo-oligosaccharides and high-titer monosaccharides from Xanthoceras sorbifolia Bunge husks: A simple stepwise synergistic pretreatment. Biomass and Bioenergy. 2026, 209:108929.

3. Ma Q, Zhou Y, Parales R.E, Jiao S, Ruan Z*, Li L. Effects of herbicide mixtures on the diversity and composition of microbial community and nitrogen cycling function on agricultural soil: A field experiment in Northeast China. Environmental Pollution. 2025, 372:125965.

4. Ma K, Li G, Cui Y, Li J, He M, Ruan Z*. Green pretreatment of Xanthoceras sorbifolia Bunge husks via hydrogen peroxide presoftening, liquid hot water pretreatment and enzymatic hydrolysis for the co-production of functional xylo-oligosaccharides and glucose. Industrial Crops and Products. 2025, 223: 120277.

5. Li Q, Ma Q, Zhou Y, Jiang X, Parales RE, Zhao S, Zhuang Y, Ruan Z*. Isolation, identification, and degradation mechanism by multi-omics of mesotrione-degrading Amycolatopsis nivea La24. J Hazard Mater. 2024 Jun 22;476:134951.

6. Wang J, Wang Y, Zhang Q, Kong D, Xing Z, Zhang W, Ruan Z*. Chryseobacterium pyrolae sp. nov., isolated from the rhizosphere soil of Pyrola calliantha H. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Dec;73(12). doi: 10.1099/ijsem.0.006068.

7. Ma Q, Li Q, Wang J, Parales R.E, Li L, Ruan Z*. 2023. Exposure to three herbicide mixtures influenced maize root-associated microbial community structure, function and the network complexity. Environ Pollut,336:122393.

8. Ma Q, Han X, Song J, Wang J, Li Q, Li L, Parales RE, Ruan Z*. 2023. Characterization of a new chlorimuron-ethyl-degrading strain Cedecea sp. LAM2020 and biodegradation pathway revealed by multiomics analysis. J Hazard Mater, 443(Part A):130197.

9. Li M, Li Q, Yao J, Sunahara G, Duran R, Zhang Q, Ruan Z*. 2022. Transcriptomic response of Pseudomonas nicosulfuronedens LAM1902 to the sulfonylurea herbicide nicosulfuron. Sci Rep, 12(1):13656.

10. Zhu J, Che J, Jiang X, Ma M, Guan D, Li L, Cao F, Zhao B, Kang Y, Zhao J, Kong D, Zhou Y, Ruan Z*. Li J^*. 2022. Leucobacter chinensis sp. nov., with plant growth-promoting potential isolated from field soil after seven-years continuous maize cropping. Int J Syst Evol Microbiol,72(8),10.1099/ijsem.0.0054

11. Ma Q,Tan H, Song J, Li M, Wang Z, Parales RE, Li L, Ruan Z^*. 2022.Effects of the long-term exposure herbicide nicosulfuron on bacterial community structure in factory field. Environ Pollut, 307:119477.

12. Tan H, Kong D, Li Q, Zhou Y,Jiang X, Wang Z, Parales RE,Ruan Z*.2022.Metabolomics reveals the mechanism of tetracycline biodegradation by a Sphingobacterium mizutaii S121. Environ Pollut, 305:119299

13. Wang T, Yang K, Ma Q, Jiang X, Zhou Y, Kong D, Wang Z, Parales RE, Li L*, Zhao X*, Ruan Z*. 2022. Rhizosphere microbial community diversity and function analysis of cut chrysanthemum during continuous monocropping. Front Microbiol.13:801546.

14. Kong D, Wang Y, LiQ, Zhou Y, Jiang X, Xing Z, Wang Z, Ruan Z*. 2022.Chryseobacterium subflavum sp. nov., isolated from soil. Int J Syst Evol Microbiol, 72(5), 10.1099/ijsem.0.005345.

15. Che J, ZhuY, Li Y, Zhang R, Ruan Z*, Zhang W*.2022. Response of bacterial communities in saline-alkali soil to different pesticide stresses. Environ Sci Pollut Res, 29(28):42709–42719.

16. Kong D, Xia Z, Gao Y, Zhou Y, Jiang X, Xu P. Guo W*,Ruan Z^*. 2022. Sporosarcina jiandibaonis sp. nov., isolated from saline soil. Int J Syst Evol Microbiol, 72(2):doi: 10.1099/ijsem.0.005244

17. Song J, Hao G, Liu L, Zhang H, Zhao D, Li X, Yang Z, Xu J, Ruan Z*, Mu Y*. 2021. Biodegradation and metabolic pathway of sulfamethoxazole by Sphingobacterium mizutaii. Sci Rep. 11(1):23130.

18. Li M, Ma Q, Kong D, Xiaoyan Han, Juan Che, Yiqing Zhou, Xu Jiang, Zhiyong Ruan,*and Qinghua Zhang*. 2021. Pseudomonas nicosulfuronedens sp. nov., a nicosulfuron degrading bacterium, isolated from a microbial consortium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 71(2):doi: 10.1099/ijsem.0.004632

19. Li M, Song J, Ma Q,Kong D, Zhou Y, Jiang X, ParalesR, Ruan Z^*, Zhang Q^*. 2020. Insight into the characteristics and new mechanism of nicosulfuron biodegradation by a Pseudomonas sp. LAM1902. J Agri Food Chem, 68(3): 826−837.

20. Song J, Han G, Wang Y,Jiang X, ZhaoD, Li M, Yang Z, Ma Q, Parales R, Ruan Z^*, Mu Y^*.2020. Pathway and kinetics of malachite green biodegradation by Pseudomonas veronii.Sci Rep,10(1): 4502.

21. Kong D, Zhang Q, Jiang X, Ma Q, Han X, Zhou Y, Xue H, Zhang Y, Zhang W, Ruan Z*. 2020. Paenibacillus solisilvae sp. nov., isolated from birch forest soil. Int J Syst Evol Microbiol, 70(4):2690-2695.

22. Li M, Kong D, Wang Y, Ma Q, Han X, Zhou Y, Jiang X, Zhang Y, Ruan Z^*, Zhang Q^*. 2019. Photobacterium salinisoli sp. nov., isolated from a sulfonylurea herbicide-degrading consortium enriched with saline soil. Int J Syst Evol Microbiol, 69(12): 3910-3916. 

23. Dong W, Zhu J, Guo X, Kong D, Zhang Q, Zhou Y, Liu X, Zhao S^*, Ruan Z^*. 2018. Characterization of AiiK, an AHL lactonase, from Kurthia huakui LAM0618^T and its application in quorum quenching on Pseudomonas aeruginosa PAO1. Sci Rep, 8(1):6013.

24. Zhou S, Song J, Dong W, Mu Y, Zhang Q, Fan Z, Wang Y, Kong D, Zhou Y, Jiang X, Zhao B^*, Han G^*, Ruan Z^*. 2017. Nicosulfuron Biodegradation by a Novel Cold-Adapted Strain Oceanisphaera psychrotolerans LAM-WHM-ZC. J Agric Food Chem, 65(47):10243-10249.

25. Song J, Wang Y, Song Y, Zhao B, Wang H, Zhou S, Kong D, Guo X, Li Y, He M, Ma K, Ruan Z^*, Yan Y^*. 2017. Brevibacillus halotolerans sp. nov., isolated from saline soil sample collected from paddy field. Int J Syst Evol Microbiol, 67(4):772-777.

26. Zhou S, Guo X, Wang H, Kong D, Wang Y, Zhu J, Dong W, He M, Hu G, Zhao B, Zhao B^*, Ruan Z^*. 2016. Chromobacterium rhizoryzae sp. nov., isolated from rice roots. Int JSyst Evol Microbiol, 66(1):3890-3896.

27. Kong D, Guo X, Zhou S, Wang H, Wang Y, Zhu J, Dong W, Li Y, He M, Hu G, Zhao B, Ruan Z^*. 2016. Frigoribacterium salinisoli sp. nov., isolated from saline soil, transfer of Frigoribacterium mesophilum to Parafrigoribacterium gen. nov. as Parafrigoribacterium mesophilum comb. nov. Int J Syst Evol Microbiol, 66(12): 5252-5259.

28. Wang H, Zhou S, Wang Y, Kong D, Guo X, Zhu J, Dong W, Ruan Z^*. 2016. Advenella alkanexedens sp. nov., an alkane-degrading bacterium isolated from biogas slurry samples. Int J Syst Evol Microbiol, 66(2):906-911.

29. Ma K^#, Ruan Z^#, Shui Z, Wang Y, Hu G, He M. 2016. Open fermentative production of fuel ethanol from food waste by an acid-tolerant mutant strain of Zymomonas mobilis. Bioresource Technol, 203:295-302.

30. Zhou S, Wang H, Wang Y, Ma K, He M, Chen X, Kong D, Guo X, Ruan Z^*, Zhao B. 2015. Oceanisphaera psychrotolerans sp nova, isolated from coastal sediment samples. Int J Syst Evol Microbiol, 65(9):2797-2802.

31. Deng Y, Guo X, Wang Y, He M, Ma K, Wang H, Chen X, Kong D, Yang Z, Ruan Z^*. 2015. Terrisporobacter petrolearius sp nov., isolated from an oilfield petroleum reservoir. Int J Syst Evol Microbiol, 65(10):3522-3526.

32. Wang Y, Song J, Zhai Y, Zhang C, Gerritsen J, Wang H, Chen X, Li Y, Zhao B, Zhao B, Ruan Z^*. 2015. Romboutsia sedimentorum sp. nov., isolated from an alkaline-saline lake sediment and emended description of the genus Romboutsia. Int J Syst Evol Microbiol, 65(Pt 4):1193-1198.

33. Ma K^#*, Ruan Z^#. 2015. Production of a lignocellulolytic enzyme system for simultaneous bio-delignification and saccharification of corn stover employing co-culture of fungi. Bioresource Technol, 175:586-593.

34. Wang H, Xiang T, Wang Y, Song J, Zhai Y, Chen X, Li Y, Zhao B, Zhao B, Ruan Z^*. 2014. Microbacterium petrolearium sp nov., isolated from an oil-contaminated water sample. Int J Syst Evol Microbiol, 64(Pt 12):4168-4172.

35. Ruan Z, Wang Y, Zhang C, Song J, Zhai Y, Zhuang Y, Wang H, Chen X, Li Y, Zhao B, Zhao B. 2014. Clostridium huakuii sp. nov., an anaerobic, acetogenic bacterium isolated from methanogenic consortia. Int J Syst Evol Microbiol, 64(Pt 12):4027-4032.

36. Kong D, Wang Y, Zhao B, Li Y, Song J, Zhai Y, Zhang C, Wang H, Chen X, Zhao B, Ruan Z^*. 2014. Lysinibacillus halotolerans sp. nov., isolated from saline-alkaline soil. IntJ Syst Evol Microbiol, 64(Pt 8):2593-2598.

37. Ruan Z, Wang Y, Song J, Jiang S, Wang H, Li Y, Zhao B, Jiang R, Zhao B. 2014. Kurthia huakuii sp nov., isolated from biogas slurry, and emended description of the genus Kurthia. Int J Syst Evol Microbiol, 64(Pt 2):518-521.

38. Ruan Z^#, Zhou S^#, Jiang S, Sun L, Zhai Y, Wang Y, Chen C, Zhao B. 2013. Isolation and characterization of a novel cinosulfuron degrading Kurthia sp. from a methanogenic microbial consortium. Bioresource Technology, 147:477-483.

授权专利

1. 阮志勇等，一种水谷鞘氨醇杆菌及其应用，2023.09.22，中国，ZL202210395822.9

2. 阮志勇等，苍白杆菌及其应用和菌剂及其在降解抗生素方面的用途，2022.09.30，中国，ZL ZL202011280815.1

3. 阮志勇等，一种副地衣芽孢杆菌、微生物菌剂及其应用，2022.03.29，中国，ZL 202011141863.2

4. 阮志勇等，假单胞菌及其应用和菌剂及其在耐盐方面的用途，2022.03.29，中国，ZL202011280780.1

5. 阮志勇等，一种N-酰基高丝氨酸内酯酶及其药物，2020.06.09，中国，ZL201710448157.4

6. 阮志勇等，细菌类漆酶laclK的基因和蛋白及应用，2019.07.23，中国，ZL201610179415.9

7. 阮志勇等，一种甲基营养型芽胞杆菌及微生物菌剂和它们的应用， 2016.07.06，中国，ZL201310628536.3

8. 阮志勇等，一种同温层芽胞杆菌及微生物菌剂和它们的应用， 2016.06.22，中国, ZL201310628563.0

9. 阮志勇等，一种华癸库特氏菌及微生物菌剂和它们的应用，2016.02.10，中国, ZL201310632005.1

10. 阮志勇等，解淀粉芽胞杆菌及微生物菌剂和它们的应用，2016.08.24，中国，ZL201310628798.X

11. 阮志勇等，一种摩加夫芽胞杆菌及微生物菌剂和它们的应用，2015.10.14，中国，ZL201310626589.1

12. 阮志勇等，一种库特氏菌及微生物菌剂和它们的应用，2015.12.30，中国，ZL201310626560.3

研究方向

原核微生物资源分类与系统学研究、耕地有机污染物微生物降解与代谢机理、健康耕地微生物资源应用与调控。

联系方式

办公电话：010-82108701

邮箱：ruanzhiyong@caas.cn